1790 में जब प्रिंस मिकालो की मृत्यु हो गई, तो वह अपने बेटे प्रिंस एंटल द्वारा सफल हो गए, जिन्होंने संगीत की परवाह नहीं की और प्रांगण के अधिकांश संगीतकारों को बर्खास्त कर दिया। हालांकि, हेडन को बरकरार रखा गया और उन्हें उनका वेतन मिलता रहा। इस बिंदु पर एक वायलिन वादक और कॉन्सर्ट मैनेजर, जोहान पीटर सॉलोमन, इंग्लैंड से आए और लंदन में ऑर्केस्ट्रल संगीत समारोहों की एक श्रृंखला में स्वयं संगीतकार द्वारा आयोजित की जाने वाली 6 नई सिम्फनी और 20 छोटी रचनाओं से कमीशन किया। हेडन ने इस प्रस्ताव को सहर्ष स्वीकार कर लिया, और दिसंबर 1790 में लंदन के लिए दोनों लोग सेट किये गए। नए साल के दिन 1791 को, हेडन इंग्लैंड पहुंचे, और अगले 18 महीने बेहद फायदेमंद साबित हुए। लंदन में अपने पहले और दूसरे दौरे पर उन्होंने जो 12 सिम्फनी लिखीं, वे उनके ऑर्केस्ट्रा आउटपुट के चरमोत्कर्ष का प्रतिनिधित्व करती हैं। उनकी शैली और बुद्धि ने ब्रिटिश दर्शकों के लिए काम किया, और उनकी लोकप्रियता उनके द्वारा दिए गए विभिन्न उपनामों में परिलक्षित होती है - जैसे, आश्चर्य (संख्या 94), सैन्य (नंबर 100), द घड़ी (नंबर 101), और ड्रमरोल (नंबर 103)। जून 1792 में हेडन ने वियना के लिए अंततः लंदन छोड़ दिया, जहां उनकी वापसी केवल शांत रूप से प्राप्त हुई थी। शायद इसने उन्हें जनवरी 1794 में इंग्लैंड की दूसरी यात्रा करने के लिए प्रेरित किया। लंदन की उनकी दूसरी यात्रा की प्रमुख रचनाएँ लंदन (या सलोमोन) सिम्फनीज़ (Nos. 99–104) और छः अप्पोनी चौकड़ी (Nos. 54-59) का दूसरा सेट थीं। लंदन में रहते हुए, हेडन प्रेरणा की और भी अधिक ऊँचाइयों तक पहुँच गया, विशेष रूप से पिछले तीन सिम्फनी में उन्होंने लिखा था (Nos. 102–104), जिनमें से बी-फ्लैट मेजर में सिम्फनी नंबर 102 विशेष रूप से प्रभावशाली है। हालाँकि किंग जॉर्ज III ने उन्हें इंग्लैंड में रहने के लिए आमंत्रित किया, लेकिन हेडन अपने मूल ऑस्ट्रिया में एस्तेरज़ी परिवार के नए प्रमुख, प्रिंस मिकॉल्स II की सेवा करने के लिए वापस आ गए। 1791 में लंदन में रहते हुए, हेडन को जॉर्ज फ्राइडरिक हैन्डल के उस्ताद के प्रदर्शन के द्वारा गहराई से स्थानांतरित कर दिया गया था। इस शैली में आगे के कामों की रचना करने का निर्णय लेते हुए, उन्होंने एक उपयुक्त लिब्रेटो प्राप्त किया, और, वियना में बसने और प्रिंस एस्टेरज़ी के लिए अपने कर्तव्यों को फिर से शुरू करने के बाद, उन्होंने ओटोरियो द क्रिएशन पर काम शुरू किया, जिसका पाठ जर्मन में बैरन गॉटफ्रीड वैन स्विटेन द्वारा अनुवादित किया गया था। जर्मन या अंग्रेजी में प्रदर्शन को सक्षम करने के लिए कार्य की योजना बनाई गई और निष्पादित की गई; ऐसा माना जाता है कि यह दो भाषाओं में टेक्स्ट अंडरले के साथ प्रकाशित पहला संगीतमय काम है। लीब्रेट्टो जॉन मिल्टन द्वारा लिखी गई महाकाव्य पैराडाइज़ लॉस्ट एंड बाइबल की उत्पत्ति किताब पर आधारित थी। क्रिएशन को पहली बार सार्वजनिक रूप से 1798 में प्रदर्शित किया गया था और बाद में भारी लोकप्रियता अर्जित की। इसके बाद हेडन ने एक और ओटोरियो का उत्पादन किया, जिसने 1801 तक उसे अवशोषित कर लिया। जेम्स थॉमसन द्वारा एक विस्तारित कविता, द सीजन्स को (बहुत कम) लिबरेटो के लिए आधार के रूप में चुना गया था, फिर से वैन स्विटन द्वारा अनुकूलित और अनुवाद किया गया ताकि जर्मन या अंग्रेजी में प्रदर्शन को सक्षम किया जा सके। ऑस्ट्रेरियो को ऑस्ट्रियाई अदालत और सार्वजनिक प्रदर्शन (हालांकि लंदन में नहीं) में बहुत सफलता मिली। हेडन के दिवंगत रचनात्मक उत्पादन में उनके संरक्षक मिकॉल्स II के लिए लिखे गए छह द्रव्यमान शामिल थे। उन्होंने स्ट्रिंग चौकड़ी की रचना भी जारी रखी, विशेष रूप से छह एर्दोदी चौकड़ी जिसे ओपस 76 के नाम से जाना जाता है। 1797 में हेडन ने ऑस्ट्रियाई साम्राज्य को सरगर्मी गीत गोट इरहल्ते फ्रांज डेन कैसर ("गॉड सेव एम्परर फ्रांसिस") दिया। जर्मनी में ऑस्ट्रियाई राजशाही के राष्ट्रगान और देशभक्ति गीत के रूप में "देउत्स्चलैंड, देउत्स्चलैंड उबर alles" ("जर्मनी, जर्मनी अबव एल्स") के रूप में एक सदी से भी अधिक समय तक इसका उपयोग किया गया था, जहां यह "राष्ट्रमंडल" के रूप में राष्ट्रगान बना रहा।” यह गीत इतना प्रिय था कि हेडन ने अपने बेहतरीन स्ट्रिंग क्वार्टर, सम्राट चौकड़ी (ओपस 76, नंबर 3) में बदलाव के लिए एक थीम के रूप में इसका उपयोग करने का फैसला किया। 1801 और 1802 में अपने अंतिम दो लोगों की रचना के बाद, हेडन ने बड़े पैमाने पर कोई काम नहीं किया। अपने जीवन के अंतिम वर्षों के दौरान, वह जाहिर तौर पर आगे के काम में असमर्थ थे। 1809 में नेपोलियन की सेना ने वियना को घेर लिया और मई में शहर में प्रवेश किया। हेडन ने अपना घर छोड़ने और आंतरिक शहर में शरण लेने से इनकार कर दिया। नेपोलियन ने हेडन के घर के बाहर एक गार्ड ऑफ ऑनर रखा, और 31 मई को enfeebled संगीतकार की शांति से मृत्यु हो गई; उसे दो दिन बाद दफनाया गया था।
