علی مطهری یکی از منتقدان جدی حمله به سفارت عربستان در تهران و مشهد بود و همواره از عناصر افراط گرایی که در تلاش هستند که روابط دیپلماتیک دو کشور اسلامی ایران و عربستان را به هم بزنند انتقاد کرده است. با بلندتر شدن زمزمه های عادی شدن روابط ایران و عربستان، دکتر مطهری نایب رئیس مجلس دهم از این موضوع به گرمی استقبال کرده است.