متن پیام رهبر انقلاب اسلامی به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
با تأسف و تأثر خبر درگذشت عالم و متفکّر برجسته جناب آقای محمدرضا حکیمی قدّس الله نفسه را دریافت کردم. ایشان دانشمندی جامع، و ادیبی چیره دست، و اندیشه ورزی نوآور، و اسلام شناسی عدالتخواه بودند. ایشان عمر را فارغ از آرایه ها و پیرایه های مادی، در خدمت معارف والای قرآن و سنّت گذرانده و آثاری ارزشمند از خود به جا نهادند. بهره گیری از محضر پرفیض و نفس گرم استادان معرفت و معنویت در مشهد مقدس، ذخیره ای از توکل و تعبّد و غنای نفس در دل و جان این شخصیت عزیز به جا نهاده بود که تا آخر عمر با برکتش وی را استوار می داشت. این جانب فقدان اندوهبار این رفیق دیرین را به خاندان مکرّم حکیمی و بازماندگان به ویژه برادر بزرگوار ایشان و نیز به همه ی دوستان و علاقمندان آن مرحوم تسلیت عرض می کنم و رحمت و مغفرت الهی را برای وی مسألت می نمایم.
سیّدعلی خامنه ای
۱ شهریور ۱۴۰۰